低征高扣對稅賦和現金流的影響執行“第十二條”政策后，報紙印刷企業可取得17%的紙張進項稅，但同時銷售收入中所含紙張部分的實際銷項稅只相當于原先的13.46%，因此增加了3.54%的進項稅，進一步降低了應交增值稅，減少了現金流出。
低征高扣對銷售利潤的影響執行“第十二條”政策后，報紙印刷企業自行購紙并以含紙價結算銷售收入，其收入和成本中均包含了新增的購紙因素。由于新增的購紙因素在會計核算收入和成本時按不同的稅率除稅，即低征高扣，因此銷售利潤也相應增長。假定印刷企業的含紙結算價中新包含的紙張成本為實際含稅成本，則銷售利潤增長部分相當于新增購紙成本的3.54%。
會計成本增加，進項稅額下降根據會計核算的規定，由于增值稅稅率的降低，會計成本和進項稅的構成發生變化，即進項稅額下降，會計成本增加。執行“第十二條”政策后，實際進項稅相當于原紙張和印刷成本的13.46%(1.17÷1.13×0.13)，因此與原核算的紙張和印刷成本相比，進項稅下降3.54%，會計成本增長3.54%，降低的進項稅部分轉化為會計成本。
通過“第十二條”政策對公司和集團的不同財務影響分析可見，公司減少的應交增值稅部分將通過結算價的含稅比例下降而全部轉化為公司的會計收入，同時必然相應增加了集團的會計成本。執行“第十二條”政策的前提是報社必須委托報紙印刷企業購紙，但該前提的實現可能受到以下幾方面因素的影響：政策利益分享問題。執行“第十二條”政策對報紙印刷企業和報紙出版單位的財務影響是相向的，即如果印刷費含稅價格不變，“第十二條”政策的會計收益將全部歸于報紙印刷企業，報紙出版單位將承擔相應的會計成本。
目前報紙印刷企業分三類：第一類是報紙出版單位下屬非獨立法人的印刷廠;第二類是關聯印刷企業，即報社或報業集團控股的印務公司;第三類是非關聯的印刷企業。第一類印刷企業是非獨立核算單位，“第十二條”政策的收益完全歸于報紙出版單位;第二類印刷企業是由報紙出版單位控股，因此報紙出版單位間接享有了“第十二條”政策的部分收益;第三類印刷企業就存在著如何與報紙出版單位分享“第十二條”政策收益問題。
報紙印刷企業的資金問題。近幾年來，許多報紙印刷企業為適應市場競爭需要，在印刷設備的更新改造上已投入大量資金，執行“第十二條”政策后，報紙印刷企業將增加購紙業務，因此資金支出的需求進一步加大，短期內可能面臨較大的資金壓力。報紙出版單位成本控制問題。紙張成本是報紙出版單位經營成本的重要組成部分，控制紙張采購環節是控制紙張成本的重要手段，因此將紙張采購業務完全轉交報紙印刷企業可能存在一定難度。
報紙印刷企業適當調低印價，減少報紙出版單位會計成本增加的幅度，讓報紙出版單位以減少現金流出的方式分享“第十二條”報紙出版單位僅調整新聞紙采購的結算環節，即紙張采購中的招標、談判、定價和合同條款的確定仍由報社負責，但紙張采購合同以報紙印刷企業的名義簽訂，紙款結算發票開具給報紙印刷企業，紙款暫由報社墊付，在報社向報紙印刷企業支付印刷費時抵沖結算。
